大雄宝殿内有释迦牟尼佛，阿弥陀佛和药师琉璃光佛。代表中、东、西三方不同世界的横三世佛。大雄宝殿是寺院的核心建筑，也是僧众朝暮集中修持的地方。大雄宝殿中供奉本师释迦牟尼佛的佛像。
在佛教寺院中，大雄宝殿就是正殿，也有称为大殿的。大雄宝殿是整座寺院的核心建筑，也是僧众朝暮集中修持的地方。
大雄是佛的德号：大者，是包含万有的意思；雄者，是摄伏群魔的意思。因为释迦牟尼佛具足圆觉智慧，能雄镇大千世界，因此佛弟子尊称他为大雄。宝殿的宝，是指佛法僧三宝。大雄宝殿中除供奉本师释迦牟尼佛的佛像外，有的寺院还会在大殿内供奉三世佛像。
所供奉的三世佛像，一般有两种组合形式：从时间上讲，为过去世迦叶佛，现在世释迦牟尼佛和末来世弥勒佛，俗称“竖三世佛”或“三时佛”。他们在佛殿的布置是：释迦佛居中，迦叶佛（或燃灯佛）居释迦佛右，弥勒佛居释迦佛左。从空间上讲，为西方极乐世界阿弥陀佛、娑婆世界释迦牟尼佛和东方净琉璃世界药师佛，俗称“横三世佛”。他们在佛殿的布置是：释迦佛居中，阿弥陀佛居释迦佛右，药师佛居释迦佛左。
大佛寺大雄宝殿，坐北向南，面阔七间，进深五间，素胎瓦歇山顶，规模宏伟，用材硕大，风格简朴，明代遗风，殿高18米，占地1270余平方米。供奉三圣如来，居中释迦牟尼佛，左边阿弥陀佛，右边药师佛，高6米，重10吨，皆以黄铜精铸，时人称“人过大佛寺，寺佛大过人”，当时佛寺之大，大佛之大，堪称岭南之冠，“大佛寺”之名也由此而来。虽历经三百多年风雨侵蚀风貌尚存。梁柱框架，亦基本保存完好。
大佛寺由“赐紫开山沙门真修僧纲司僧纲”首任住持。于“康熙三年岁次甲辰孟冬吉日”，“平南王尚可喜薰沐题”《鼎建大佛寺记》石碑，此碑至今仍保存在大雄宝殿左前方。另有《鼎建大佛寺题名碑》兀立大殿右侧。这两碑对研究大佛寺历史沿革,有较高的参考价值。1993年8月，广州市人民政府公布大佛寺为广州市文物保护单位。2009年，大佛寺大殿被评为“省级文物保护单位”，大佛寺在海内外影响不断提高。
